น้ำเป็นปัจจัยหนึ่งมีสำคัญมากต่อปลา เพราะมีผลต่อปลาโดยตรง เช่น คุณภาพน้ำที่เหมาะสมจะทำให้ปลาเจริญเติบโตเร็ว ปลาไม่เกิดความเครียด สุขภาพดี แข็งแรง มีความต้านทานต่อโรคได้ดี น้ำที่นำมาใช้ในการเลี้ยงปลา สามารถนำมาจากแหล่งต่างๆ ดังนี้
1.น้ำที่ได้จากลำคลอง หนอง บึง จะมีตะกอนดินและแร่ธาตุจากดิน และหินละลายในน้ำ รวมทั้งจุลินทรีย์และปรสิตที่ปะปนอยู่ในน้ำ ดังนั้นจึงควรนำน้ำจากแหล่งนี้ไปปรับปรุงคุณภาพก่อน แต่ขั้นตอนนั้นยุ่งยากเพราะน้ำไม่สะอาดจริงจึงไม่นิยมใช้น้ำที่ได้จากแหล่งนี้
2.น้ำบาดาล เป็นน้ำที่สูบจากใต้ดิน มีแร่ธาตุละลายปนมา เช่น สนิมเหล็ก น้ำจะมีกลิ่นแร่ธาตุ กลิ่นโคลนและมีปริมาณออกซิเจนต่ำ ซึ่งแก้ไขได้โดย นำน้ำมาพักทิ้งไว้ 1-2 วัน ก็สามารถนำไปเลี้ยงปลาได้
3.น้ำประปา เป็นน้ำที่สะอาดและมีคุณสมบัติเหมาะสมจึงนิยมใช้น้ำชนิดนี้เลี้ยงปลามากที่สุด เนื่องจากน้ำประปาผ่านการบำบัดและการกรองหลายขั้นตอน ทำให้น้ำประปาปราศจากเชื้อโรค ซึ่งน้ำประปายังมีปัญหาเรื่องปริมาณคลอรีนที่หลงเหลืออยู่ในน้ำ ดังนั้น จึงมีวิธีการกำจัดคลอรีน ซึ่งสามารถดำเนินการได้ดังนี้
วิธีที่1 พักน้ำไว้ 2-3 วัน หรือพักไว้ในที่แจ้งตากแดดตลอด 24 ชั่วโมง คลอรีนจะแตกตัวระเหยไปกับอากาศ
วิธีที่2 กรองน้ำประปาด้วยถ่านคาร์บอน ( ativated carbon )
วิธีที่3 วิธีนี้สำหรับการนำน้ำประปาไปใช้เลี้ยงปลาทันที โดยการเติมโซเดียมไธโอซัลเฟตหรือที่รู้จักกันดีในชื่อเกล็ดขจัดคลอรีน ในอัตรา 1 เกล็ดต่อน้ำ 5 ลิตร
จากนั้นก็เป่าออกซิเจนเพื่อเป็นการช่วยให้คลอรีนระเหยออก
